HPV具有严格嗜上皮细胞的特点，HPV侵入机体后，主要限定于皮肤和粘膜上皮细胞，不进入血液扩散到全身。在临床上，根据HPV亚型致病力大小或致癌危险性大小不同可将HPV分为低危型和高危型两类。低危性HPV主要引起肛门皮肤及男性外生殖器、女性大小阴唇、尿道口、阴道部位的外生性疣类病变和低度子宫颈上皮内瘤，其病毒亚型主要有HPV6、11、30、39、42、43型及HPV44型。高危型HPV除可引起外生殖器疣外，更重要的是可引起外生殖器癌、宫颈癌及高度子宫颈上皮内瘤，其病毒亚型主要有HPV11、18、31、33、35、45、51、52、56、58型和HPV61型。
1、尖锐湿疣
HPV感染最常见的部位之一是肛门外生殖器，引起肛门外生殖器尖锐湿疣，其中HPV6型与HPV11型是引起尖锐湿疣的主要亚型，少数由HPV16和HPV18型引起。
近年来，尖锐湿疣发病率逐年升高，目前已在性传播疾病中排第三的位置，发病率仅次于淋病和非淋。
2、扁平疣、寻常疣、跖疣
扁平疣、寻常疣、跖疣均因感染HPV所致。感染后的皮肤表面出现异常增长而形成疣。表面为圆形、多角性丘疹、肉赘，颜色为淡褐色、黄褐色，多发于手臂、腋窝、颈面部。
3、HPV与宫颈癌、生殖器癌
在HPV亚型中至少有27种HPV亚型具有致癌的潜能，可引起各种恶性肿瘤。研究表明，HPV引起的肛门癌、阴茎癌、女阴癌和宫颈癌中，宫颈癌最常见，99.7%的宫颈癌中都能发现高危型HPV感染，其中以HPV16型、HPV18型最常见，约占发病的65%，是诱发宫颈癌的首要潜在病因，并通常通过性传播感染。大约90%高危型感染者能在16个月内自然转阴，而一些没能清除高危型的妇女可继续发展为CIN3，大约1/3的CIN3 最终可发展为浸润癌。
